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伟德国际victor1946欧光朔和李雪明课题组合作发现新型生物结构“纳米毛”

生物大分子在动物体内原位结构的研究是生物结构领域的前沿，其技术管线包括：高压冷冻动物样品（High-pressure freezing）、冷冻聚焦离子束扫描电镜（Cryo-FIB-SEM）对动物样品进行低温离子切削获得厚度小于200纳米的冷冻薄片、300KV冷冻透射电镜(TEM)对薄片进行电子断层成像（Cryo-ET）的数据收集。2022年6月7日，bevictor伟德官网生命科学院欧光朔和李雪明课题组在《美国科学院院报》（Proc Natl Acad Sci U S A）杂志上在线发表了题...

06 Jun

伟德国际victor1946杨雪瑞课题组开发深度学习工具DeepLinc，使用单细胞空间转录组数据构建细胞…

作为近年来技术发展的前沿，单细胞空间组学技术同时提供了生理组织中细胞的空间定位及细胞内基因组、转录组、蛋白组等定量组学数据。细胞空间定位信息与分子特征谱的耦合为解析组织中细胞组装与互作关系、理解组织的形成与功能提供了前所未有的丰富信息。考虑到单细胞空间组学数据的复杂性，包括其多模态、高噪音、高稀疏性与高维度等特征，如何通过针对性、高效的算法设计，从该数据中提取深层次的隐藏信息，挖掘细胞内分子特...

03 Jun

伟德国际victor1946郗乔然课题组揭示染色质阅读器TRIM66调控全能样干细胞的分子机制

在小鼠中，合子基因组激活（zygotic genome activation，ZGA）发生在早期胚胎的2细胞阶段，此阶段任何与基因转录调控相关的事件对于整个胚胎发育都是至关重要的。有趣的是，在小鼠胚胎干细胞（mouse embryonic stem cells，mESCs）中，有一小部分的细胞群体能够瞬时性表达包括Zscan4基因簇和内源性逆转录病毒（ERVs）MERVL在内的转录本，说明了此类细胞与小鼠2细胞胚胎卵裂球（blastomere）的相似性。因此这些细胞被命名为类2细...

19 May

伟德国际victor1946钟毅课题组揭示衰老后记忆容易受到干扰的分子机制

我们每个人都会逐渐衰老。衰老后，我们最常抱怨的事情之一是容易忘事。为什么会这样呢？可不可以在衰老后重新拥有年轻的记忆水平呢？这些问题的答案依赖于神经科学领域的深入发展。心理学家认为衰老引起的记忆衰退的一个重要原因是老年人比年轻人更容易受到外界干扰的影响。然而，这种解释背后的微观生物学机制一直没有被揭示。小小的果蝇在历史上已经多次帮助研究者们理解了很多大问题，比如遗传学规律、胚胎发育机理、先天免...

07 May

bevictor伟德官网李雪明、沈渊团队与北京科技大学陈健生团队合作开发冷冻电镜颗粒挑选的持续…

近年来，深度学习逐渐成为冷冻电镜图像处理流程中颗粒挑选的常用方法。然而，现有基于深度学习的颗粒挑选方法无法在新数据训练中动态地向模型中积累新的知识。也就是说，现有模型在新样本上被训练后，虽然能够在最新的数据上获得良好的性能，但是往往无法保持其在旧数据上的颗粒挑选精度。此外，现有方法都是在特定数据集上训练出通用模型，当要加入新的训练数据时存储和计算成本都很高，大大限制了其在未曾见过的数据上的识别...

07 May

伟德国际victor1946欧光朔课题组报道蛋白质与核酸的相分离调控生殖-寿命权衡的机理

衰老是如何进化出来的？George C. Williams 于 1957 年提出拮抗多效理论 (antagonistic pleiotropic)作为衰老的进化解释。多效性是一种一个基因控制多个性状的现象。拮抗多效性是指一个基因调控的某些性状有利于生命早期的适应性，而另一些性状则对生命晚期的适应性有害，生命在生活史的权衡中，被迫接受晚期有害作为早期有利的必要代价，即，生命无法通过自然选择达到完美。虽然在生理水平上拮抗多效理论已经获得了一定程...

28 Apr

伟德国际victor1946陈柱成课题组解析人源PBAF染色质重塑复合物结合核小体的结构

2022年4月27日，伟德国际victor1946/结构生物学高精尖创新中心/清华-北大生命科学联合中心陈柱成教授研究团队在《自然》杂志在线发表题为“人源PBAF染色质重塑复合物结合核小体的结构”（Structure of human PBAF chromatin remodeling complex bound to a nucleosome）的研究论文。该论文报道了人源染色质重塑复合物PBAF在活性状态下结合核小体的结构，揭示了由12个亚基组成的PBAF复合物的组装方式和识别核小体的机制，为众...

06 Apr

伟德国际victor1946钟毅课题组阐释Rac1-依赖的遗忘过程介导记忆灵活提取的分子机制

在瞬息万变的自然环境中，动物需要根据自己所处的环境与状态灵活地提取记忆。然而，日常情绪如何快速且直接地影响记忆痕迹（memory engram）的提取效率目前还缺乏相关神经机制的阐释。记忆被认为存储在一群被称为痕迹细胞（engram cell）的神经元集合中，且存在多种状态，如沉默态（不可提取）、潜伏态（可以提取）和活跃态（正在提取）。在沉默状态下，只有人为激活痕迹细胞才能诱导记忆表达，而潜伏的痕迹细胞可以通过自然条...

02 Apr

伟德国际victor1946葛亮课题组发现新型聚集体自噬受体CCT2介导固态聚集体的清除

2022年4月1日，bevictor伟德官网葛亮课题组在《细胞》（Cell）期刊上在线发表题为“聚集体自噬受体CCT2介导固态聚集体清除”（CCT2 is an aggrephagy receptor for clearance of solid protein aggregates）的研究论文，发现了一种新型的聚集体自噬受体CCT2在清除固态蛋白聚集体中的重要作用。聚集体自噬是清除细胞内毒性蛋白聚集体的重要途径，也是治疗聚集体相关疾病例如神经退行性疾病的重要靶点。在聚集体自噬过程中，自噬...

19 Mar

伟德国际victor1946薛毅课题组在理性设计RNA瞬态结构上取得进展

RNA在溶液中除了存在自由能较低的高丰度的基态构象（Ground States），往往还存在自由能较高的低丰度的激发态构象（Excited States，也称瞬态构象）。多种构象之间的切换在RNA与配体的识别，折叠和去折叠，RNA-蛋白复合物的组装，以及酶催化等重要的生物学过程中多有涉及，并且跨越了从皮秒到秒甚至更慢的时间尺度。RNA的构象切换经常发生在碱基错配、顶环、内环、凸环等比较动态的区域及其附近，并且有相当一部分是以碱基对重...

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