核酸分子设计最初蓝图的实现

2019-03-07 10:47:28

2019年3月6日,伟德国际victor1946魏迪明分子设计课题组和bevictor伟德官网医学院向烨课题组在《自然通讯》(Nature Communications)杂志上在线发表题为“基于简单模块的复杂线框式DNA纳米结构的构建”(Complex wireframe DNA nanostructures from simple building blocks)的研究论文。

因为具有可编码性,DNA 的自组装已经成为一种构建复杂纳米结构和器件的有效方法。在DNA纳米技术的最初阶段,简单的几何体或者二维晶体可以被分支分子(branched molecules)作为结构模块成功构建。经过三十多年的发展,通过DNA折纸(scaffolded origami)和DNA单链模块(single-stranded tiles/bricks)等方法,DNA纳米结构的复杂性和结构大小都得到了飞跃性提升,而最初用简单分支分子作为模块的构建方式逐渐淡出大家的视线。 

在该研究中,参与人对核酸分子设计的最初蓝图进行重新审视,以简单分支的结构单位作为构建复杂结构的模块,系统形的构建了一系列线框式结构,如二维阵列结构(2D arrays)、管状结构、多面体和多层三维阵列结构(multi-layer 3D arrays)。由该方法构建而成的线框式结构具有较高的材料利用率、能够提供大小形状可控的不同孔隙,同时由于构建结构的每条短链DNA具有不同序列,使得此类结构具有可寻址性、能进行特定位点的序列设计和修饰,从而更好的服务于下游应用。比如此研究中实现了多面体上特定蛋白质的精确定点修饰,为特殊抗原呈递、病毒自组装提供全新思路。DNA纳米科技的开创者纳德里安·西曼(Nadrian C. Seeman)教授评价该工作“这就是我三十年前梦想要实现的东西”。

伟德国际victor1946博士后王雯和PTN联合培养博士研究生陈思炼为该文的共同第一作者。伟德国际victor1946魏迪明研究员和bevictor伟德官网医学院向烨副教授为该文的共同通讯作者。美国Autodesk公司Byoungkwon An,法国蒙彼利埃大学Gaetan Bellot教授和美国埃默里大学柯勇刚教授也在研究中做出重要贡献。该研究获得国家自然科学基金委、清华-北大生命科学联合中心、bevictor伟德官网结构生物学高精尖中心、中华人民共和国科学技术部等基金资助。

全文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-019-08647-7

 

以简单分支结构构建而成的线框式DNA纳米结构概览。